Простийпошук |
Розширенийпошук |
Покажчики
|
Професійний пошук |
Рубрикатор НБУВ |
Розподілений пошук |
Бази даних
Наукова періодика України - результати пошуку
Книжкові видання та компакт-дискиЖурнали та продовжувані виданняАвтореферати дисертаційРеферативна база данихНаукова періодика УкраїниТематичний навігаторАвторитетний файл імен осіб
 |
Для швидкої роботи та реалізації всіх функціональних можливостей пошукової системи використовуйте браузер "Mozilla Firefox" |
|
|
Повнотекстовий пошук
| Знайдено в інших БД: | Реферативна база даних (3) |
Список видань за алфавітом назв: Авторський покажчик Покажчик назв публікацій  |
Пошуковий запит: (<.>A=Hurmach V$<.>) | |||
|
Загальна кількість знайдених документів : 4 Представлено документи з 1 до 4 |
|||
| 1. | 
Hurmach V. V. Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods [Електронний ресурс] / V. V. Hurmach, O. M. Balinskyi, M. O. Platonov, O. M. Boyko, P. O. Borysko, Yu. I. Prylutskyy // Biopolymers and cell. - 2014. - Vol. 30, № 4. - С. 321-325. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BPK_2014_30_4_12 Пошук нових хімічних структур, здатних виявляти специфічну біологічну дію, є комплексною проблемою, що потребує використання сучасних методів молекулярного моделювання. Відомо, що SH2 домени відіграють важливу роль в онтогенезі як посередники специфічних білково-білкових взаємодій. Мета роботи - розробка алгоритму для дослідження властивостей зв'язування SH2 доменів, пошук потенційно активних речовин для всього класу SH2 доменів. Використано комплекс методів комп'ютерного моделювання для створення універсального цільового сету потенційно активних речовин на весь клас SH2 доменів. Проведено кластерний аналіз наявних тривимірних структур SH2 доменів та визначено загальні фармакофорні моделі, які застосовано для віртуального скринінгу колекції лікоподібних речовин підприємства Enamine. Запропоновано техніку проектування бібліотеки потенційно активних речовин для класу SH2 доменів. Висновки: розроблено оригінальний алгоритм дослідження SH2 доменів із застосуванням методу молекулярного докінгу. Використовуючи цей алгоритм, знайдено активні речовини для SH2 доменів. | ||
| 2. | 
Hurmach V. V. Comparative analysis of SH2 domain structures [Електронний ресурс] / V. V. Hurmach, M. O. Platonov, O. M. Boyko, Yu. I. Prylutskyy // Біологічні студії. - 2015. - Т. 9, № 1. - С. 5-14. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/bist_2015_9_1_2 Src Homology 2 (SH2) - компактні глобулярні домени, які беруть участь у міжклітинній сигналізації та відіграють важливу роль як посередники специфічних протеїн-протеїнових взаємодій. Вони складаються зі 100-та амінокислот, які формують 7 beta-складок і 2 alpha-спіралі. Домени SH2 містять 2 висококонсервативні ділянки кишені зв'язування - pTyr і pTyr+3. Знання структури білкових комплексів є важливим кроком у розумінні механізмів їх функціонування. З використанням in silico методів проаналізовано амінокислотні послідовності сайту зв'язування доменів SH2 і ділянки, прилеглі до нього. Усі домени SH2 було розподілено на групи за подібністю сиквенсів. Аналіз консервативності й ідентичності доменів SH2 виявив ділянки послідовностей, які притаманні всім доменам, і ділянки, притаманні лише деяким доменам. Окрім того, дослідження їх поверхні засвідчило, що найбільш консервативні ділянки займають найменшу площу. Одержані результати вказують на здатність доменів SH2 розпізнавати не тільки лінійні фосфопептидні послідовності, що відкриває нові уявлення стосовно інтерпретації можливих мехаінізмів взаємодії доменів SH2 з лігандами (наприклад, можливість зв'язування з протеїнами або лігандами не тільки в межах сайту зв'язування домену). | ||
| 3. | 
Hurmach V. V. New conformational properties of SH2 domain binding pocket [Електронний ресурс] / V. V. Hurmach, M. O. Platonov, Yu. I. Prylutskyy // The Ukrainian Biochemical Journal. - 2015. - Vol. 87, № 5. - С. 133-140. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BioChem_2015_87_5_16 Зазначено, що конформаційні зміни протеїнів відіграють важливу роль в їх біологічному функціонуванні, зокрема взаємодіях типу "ліганд-протеїн" і "протеїн-протеїн". Мета роботи - вивчення конформаційної рухливості найбільш репрезентативних доменів SH2. Виявлено, що кишеня зв'язування домену SH2 включає як гнучкі, так і негнучкі ділянки: найбільш негнучкою є центральна частина, а гнучкими - pTyr-зв'язувальна та гідрофобна частини. Результати комп'ютерного аналізу демонструють нові конформаційні властивості доменів SH2, які сприятимуть майбутній розробці лікарських засобів. | ||
| 4. |
Demenko D. Computer modeling of direct factor Xa inhibitors [Електронний ресурс] / D. Demenko, V. Hurmach, V. Chernyshenko // The Ukrainian Biochemical Journal. - 2018. - Vol. 90, № 3. - С. 108. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BioChem_2018_90_3_17 | ||
Попередній перегляд: 
Реферативна БД
 |
| Відділ наукової організації електронних інформаційних ресурсів |
 Пам`ятка користувача |